162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1338 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1338  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0504  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  51.01 
 
 		 247 aa  254  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0033  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  37.2 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  25.3 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  27.45 
 
 		 336 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  22.43 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  27.51 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  24.62 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  24.77 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  27.33 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  24.91 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 660 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  26.2 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  23.73 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  24.24 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  21.69 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  21.53 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  23.86 
 
 		 321 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  23.08 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  21.94 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  24.03 
 
 		 535 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2487  type II secretion system protein  24.56 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.744941  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0538  type II secretion system protein  21.24 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  24.29 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  21.9 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  24.06 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  21.9 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  23.25 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  23.28 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 323 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  22.01 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  25 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  21.72 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  25 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  23.58 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  22.99 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  23.5 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  21.59 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  22.37 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  23.53 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  23.44 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  22.18 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  25 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  23.83 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  21.94 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  21.31 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  21.14 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  21.05 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  22.4 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  22.39 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  21.74 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  24.06 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  25.98 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  25 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  23.76 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  23.32 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  28.23 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  25.94 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  22.38 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  28.23 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  23.44 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  23.44 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  23.44 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  22.86 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  23.32 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  22.03 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  24.17 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  22.66 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  20.9 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  21.69 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  23.74 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  22.34 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  25.2 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  23.08 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  28.23 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  21.05 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  25.2 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  25.2 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  25.2 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  25.2 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  25.2 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  23.14 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  22.92 
 
 		 325 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  21.13 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  22.15 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0773  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  21.02 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.544997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>