40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1903 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  100 
 
 		 349 aa  706    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  55.84 
 
 		 349 aa  391  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  52.83 
 
 		 329 aa  345  6e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  37.69 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  37.25 
 
 		 644 aa  193  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  37.41 
 
 		 716 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  35.49 
 
 		 641 aa  173  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  34.52 
 
 		 652 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 647 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  31.71 
 
 		 660 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  28.97 
 
 		 807 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 802 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  35.44 
 
 		 715 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  29.68 
 
 		 625 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  32.63 
 
 		 536 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  29.64 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  29.04 
 
 		 684 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  26.56 
 
 		 601 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  27.85 
 
 		 697 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  25.16 
 
 		 610 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  27.36 
 
 		 679 aa  106  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  26.65 
 
 		 678 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  27.76 
 
 		 450 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  27.13 
 
 		 625 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  24.52 
 
 		 680 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  22.71 
 
 		 604 aa  79.7  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  23.51 
 
 		 590 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7218  type II secretion system protein  25.76 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.329226 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5619  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  22.78 
 
 		 615 aa  49.7  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7219  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.981655  normal  0.304711 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  26.15 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0127  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 630 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.887891  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  23.18 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  23.18 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  23.64 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  24.74 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  23.39 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>