61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1343 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  100 
 
 
256 aa  479  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1871  type II secretion system protein  59.05 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0937784  normal  0.742106 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1404  type II secretion system protein  60.34 
 
 
248 aa  241  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.733447 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0423  hypothetical protein  29.47 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  25 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  25.81 
 
 
335 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  26.35 
 
 
335 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  24.38 
 
 
450 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  21.85 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  22.64 
 
 
807 aa  56.6  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  22.33 
 
 
644 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  29.73 
 
 
336 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  24.88 
 
 
652 aa  52.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  26.23 
 
 
349 aa  52.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  24.59 
 
 
802 aa  52.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  25.12 
 
 
647 aa  52  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  21.98 
 
 
337 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0911  type II secretion system protein  24.11 
 
 
298 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  28.69 
 
 
325 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  31.75 
 
 
330 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  28.67 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  28.44 
 
 
536 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  24.29 
 
 
641 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  25.2 
 
 
280 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1035  type II secretion system protein  20.54 
 
 
298 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  22.55 
 
 
660 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  24.59 
 
 
325 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  27.18 
 
 
716 aa  46.2  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  27.87 
 
 
325 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  22.01 
 
 
625 aa  45.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  22.86 
 
 
324 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  23.4 
 
 
327 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  27.87 
 
 
325 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  27.87 
 
 
325 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0195  Type II secretion system F domain protein  25.84 
 
 
616 aa  45.4  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372674  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  27.64 
 
 
325 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  29.01 
 
 
313 aa  45.4  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  29.31 
 
 
325 aa  45.4  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  25.96 
 
 
321 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7219  type II secretion system protein  26.53 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.981655  normal  0.304711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  22.4 
 
 
678 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  25.42 
 
 
324 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  24.57 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  28.57 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  28.57 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  25.56 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0610  type II secretion system protein  23.01 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  30.83 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  22.86 
 
 
332 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.17 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  27.41 
 
 
325 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  24.8 
 
 
322 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  26.83 
 
 
325 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  26.83 
 
 
325 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  24.03 
 
 
324 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  25.57 
 
 
715 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  27.41 
 
 
325 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  27.41 
 
 
325 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  20.75 
 
 
324 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  29 
 
 
320 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  26.61 
 
 
332 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>