36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2001 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  100 
 
 		 349 aa  710    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  56.41 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  52.74 
 
 		 329 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  39.75 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  39.04 
 
 		 716 aa  196  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  34.6 
 
 		 644 aa  193  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  33.12 
 
 		 641 aa  176  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  29.5 
 
 		 660 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  29.89 
 
 		 647 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  33.43 
 
 		 652 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 802 aa  155  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  32.19 
 
 		 625 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 807 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 715 aa  136  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  31.53 
 
 		 536 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  33.62 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  27.22 
 
 		 684 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  27.89 
 
 		 697 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 679 aa  122  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 610 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  28.24 
 
 		 601 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  28.79 
 
 		 678 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  25 
 
 		 625 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 450 aa  97.4  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  23.44 
 
 		 680 aa  87  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  24.67 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  22.46 
 
 		 604 aa  77.4  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  19.46 
 
 		 615 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  21.14 
 
 		 590 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7219  type II secretion system protein  24.07 
 
 		 287 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.981655  normal  0.304711 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2700  tight adherence protein TadC  23.6 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2322  type II secretion system protein  23.6 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1033  type II secretion system protein  25 
 
 		 272 aa  43.1  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0423  hypothetical protein  20.26 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  21.02 
 
 		 336 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>