31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2405 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  100 
 
 		 450 aa  910    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  30.99 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  27.76 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  27.08 
 
 		 644 aa  97.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  26.58 
 
 		 329 aa  97.1  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  27.24 
 
 		 716 aa  97.1  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 652 aa  94.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  24.59 
 
 		 647 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  25.2 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  22.57 
 
 		 807 aa  87.8  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  22.08 
 
 		 715 aa  86.7  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  24.08 
 
 		 802 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  21.49 
 
 		 660 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  22.67 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  21.69 
 
 		 536 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  22.82 
 
 		 684 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 604 aa  67.8  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  23.74 
 
 		 625 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  20.6 
 
 		 601 aa  63.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  23.45 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  25.12 
 
 		 610 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  22.83 
 
 		 697 aa  60.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  24.35 
 
 		 590 aa  60.5  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  21.08 
 
 		 625 aa  58.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  21.83 
 
 		 679 aa  53.9  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  24.38 
 
 		 256 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  19.81 
 
 		 678 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  20.35 
 
 		 680 aa  43.5  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  39.13 
 
 		 1005 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 291 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>