165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0781 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0781  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 283 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00253796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  24.24 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  26.56 
 
 		 329 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  31.67 
 
 		 310 aa  89.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  28.3 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  32.65 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  32.05 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  32.3 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  29.19 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  30.98 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  23.74 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  27.5 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2487  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.744941  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  31.22 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  28.44 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  33.69 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  33.9 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  29.19 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  23.98 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  24.56 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  29.95 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  30.23 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  26.2 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 535 aa  72.8  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  26.7 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  23.58 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  35 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  23.39 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 660 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  25.95 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  29.03 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  24.77 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  28.3 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  22.44 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  29.29 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  29.65 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  29.19 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  30 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  23.92 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  22.95 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  30 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  30 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  26.63 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  22.44 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  32.24 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  25.2 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  28.27 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  29 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  19.87 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  24.52 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  23.67 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  20.35 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7219  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.981655  normal  0.304711 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  23.57 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  21.15 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  24.04 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20340  Flp pilus assembly protein TadB  28.03 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  0.127493 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  22.36 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  23.58 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  25.34 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  22.35 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  24.02 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  22.92 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  21.67 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  31.88 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  24.2 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>