11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0854 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0854  type II secretion system protein  100 
 
 		 261 aa  504  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.243873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1402  type II secretion system protein  76.83 
 
 		 262 aa  345  4e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1869  type II secretion system protein  76.45 
 
 		 262 aa  342  4e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1345  type II secretion system protein  64.37 
 
 		 261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.24164 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0425  type II secretion system protein  33.18 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  28.51 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 802 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  32.12 
 
 		 307 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  19.44 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  21.3 
 
 		 716 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 715 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>