15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1345 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1345  type II secretion system protein  100 
 
 		 261 aa  499  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.24164 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0854  type II secretion system protein  64.37 
 
 		 261 aa  348  4e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.243873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1402  type II secretion system protein  68.73 
 
 		 262 aa  308  5e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1869  type II secretion system protein  69.11 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0425  type II secretion system protein  34.72 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 582 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  25.53 
 
 		 625 aa  52.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  20 
 
 		 716 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  25.32 
 
 		 610 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  20.81 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  22.16 
 
 		 625 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  24.18 
 
 		 601 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0556  type II secretion system protein  44.44 
 
 		 313 aa  42.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  25.3 
 
 		 574 aa  42.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>