16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0425 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0425  type II secretion system protein  100 
 
 		 271 aa  525  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1345  type II secretion system protein  34.72 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.24164 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0854  type II secretion system protein  33.18 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.243873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1402  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1869  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  27.47 
 
 		 641 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  26.03 
 
 		 716 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  26.29 
 
 		 625 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  26.38 
 
 		 336 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  27.61 
 
 		 337 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  25.79 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  21.29 
 
 		 535 aa  45.8  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  22.16 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 644 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  27.5 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>