13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1402 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1402  type II secretion system protein  100 
 
 		 262 aa  504  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1869  type II secretion system protein  98.09 
 
 		 262 aa  497  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0854  type II secretion system protein  76.83 
 
 		 261 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.243873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1345  type II secretion system protein  68.73 
 
 		 261 aa  347  1e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.24164 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0425  type II secretion system protein  31.56 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06192  Flp pilus assembly protein TadB  34.57 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 316 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  23.15 
 
 		 625 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  21.26 
 
 		 716 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  23.26 
 
 		 625 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  22.15 
 
 		 582 aa  42.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  24.74 
 
 		 715 aa  42  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>