107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5667 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  100 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  70.89 
 
 		 237 aa  352  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  73.11 
 
 		 238 aa  351  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  72.57 
 
 		 237 aa  347  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  71.98 
 
 		 266 aa  342  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  72.89 
 
 		 237 aa  331  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  65.94 
 
 		 236 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  52.17 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  51.74 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  50.65 
 
 		 232 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  46.72 
 
 		 248 aa  197  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  42.92 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  43.1 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  42.79 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  43.46 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  43.67 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  36.48 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  36.4 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  35.65 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  33.19 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  31.05 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  30.77 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  30.47 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  30.36 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  29.18 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  31.66 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  30.85 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  30.85 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  30.85 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  30.99 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  28.93 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  30.35 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  30.35 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  26.77 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  25.76 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  29.19 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  25.74 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  27.39 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  25.25 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  28.36 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.07 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  28.14 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  29.95 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  28.79 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  28.24 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  27.49 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  29.31 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 222 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  23.93 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  24.47 
 
 		 234 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  31.3 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  25.89 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  26.03 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  25.76 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  25.13 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  24.48 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  25.7 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  26.13 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  25.62 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  25.37 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  25.38 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  25.22 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  26.01 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  28.02 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  26.01 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  23.88 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  23.88 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  25.75 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  25.41 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  25.37 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  23.53 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  23.53 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  25.49 
 
 		 241 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  22.22 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  23.27 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  25.56 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  25.49 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  25.35 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  25.25 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  25.25 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  23.76 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  26.55 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  24.47 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.76 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  24.66 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  22.39 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  24.75 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  29.1 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  22.73 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  24.47 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  24.66 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  45 
 
 		 486 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  27.94 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  27.54 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>