209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1029 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 241 aa  493  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  99.17 
 
 		 241 aa  490  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  77.88 
 
 		 237 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  74.45 
 
 		 228 aa  351  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  61.67 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  63.83 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  55.79 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  55.88 
 
 		 245 aa  239  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  55 
 
 		 239 aa  237  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  54.47 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  53.42 
 
 		 240 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  50.86 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  58.13 
 
 		 203 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  58.13 
 
 		 203 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  50.21 
 
 		 240 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  50.21 
 
 		 336 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  50.21 
 
 		 344 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  50.21 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  50.21 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  50.21 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  48.48 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  48.94 
 
 		 240 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  48.48 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  48.48 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  46.75 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  46.55 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  46.55 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  46.98 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  46.78 
 
 		 242 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  46.32 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  45.06 
 
 		 242 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  46.12 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  46.12 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  46.75 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  46.75 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  50.65 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  44.54 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  43.4 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  45.37 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  43.04 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  48.48 
 
 		 248 aa  185  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  46.12 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  46.98 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  41.81 
 
 		 233 aa  158  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  54.61 
 
 		 149 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  38.57 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  33.62 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  31.16 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  30.6 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  28.82 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.64 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  32.81 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  24.89 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  45.57 
 
 		 99 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  26.61 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  28.24 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  41.58 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  31.21 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  30.67 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  29.34 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  33.17 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  30.25 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  33.17 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  31.91 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  28.28 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  29.23 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  25.25 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  27.59 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  29.15 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  31.71 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  27.92 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  32.2 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  32.2 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  29.88 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  26.4 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.57 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.68 
 
 		 223 aa  62  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.57 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  31.86 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  31.86 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  32.32 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  28.76 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  30.67 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  28.22 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  33.54 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  29.34 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>