219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4315 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  98.33 
 
 		 240 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  87.55 
 
 		 266 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  89.96 
 
 		 240 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  87.45 
 
 		 252 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  78.39 
 
 		 239 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  66.39 
 
 		 242 aa  338  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  66.38 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 		 336 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 		 316 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  61.92 
 
 		 240 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  63.04 
 
 		 240 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  54.96 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  52.3 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  48.95 
 
 		 241 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  53.45 
 
 		 239 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  50.86 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  47.46 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  46.25 
 
 		 242 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  46.64 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  53.88 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  48.48 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  48.05 
 
 		 241 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  52.36 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  47.62 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  47.62 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 237 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  52.4 
 
 		 248 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  53.02 
 
 		 233 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  51.72 
 
 		 234 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  45.49 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  47.41 
 
 		 228 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  67.57 
 
 		 149 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  49.58 
 
 		 245 aa  201  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  49.57 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  45.38 
 
 		 235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  54.68 
 
 		 203 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  54.68 
 
 		 203 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  44.4 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  35.29 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  35.27 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  37.28 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  34.6 
 
 		 227 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  63.29 
 
 		 99 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  31.09 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  31.73 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  28.87 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  34.15 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  29.17 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  28.92 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  31.12 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  29.49 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  33.74 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  30.39 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  31.69 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  31.69 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  25.7 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  30.56 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  31.69 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  31.8 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  31.8 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  30.29 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  29.88 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  32.89 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  33.99 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  26.46 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.05 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  29.17 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  30.96 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  28.78 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  28.03 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  29.19 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  29.21 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  26.48 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  27.92 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  28.24 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  29.09 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  27.1 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  29.46 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.63 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  27.16 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  24.18 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  31.29 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>