143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4991 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  100 
 
 
243 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  68.53 
 
 
237 aa  332  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  68.1 
 
 
237 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  66.38 
 
 
236 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  67.26 
 
 
243 aa  316  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  63.68 
 
 
248 aa  304  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  48.5 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  47.19 
 
 
241 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  46.84 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  45.53 
 
 
232 aa  198  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  42.92 
 
 
239 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  44.64 
 
 
238 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  43.53 
 
 
237 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  42.67 
 
 
236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  42.92 
 
 
237 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  41.52 
 
 
237 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  39.57 
 
 
242 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  34.33 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  35.4 
 
 
247 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  34.93 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  32 
 
 
223 aa  115  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  31.71 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  31.2 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  25.52 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  32.45 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  29.85 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  28 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  30.2 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  26.5 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  27.71 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  30.15 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  29.53 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  29.53 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  29.26 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  29.53 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  29.53 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  26.58 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  29.53 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  27.48 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  26.85 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  32.28 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  25.93 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  25.93 
 
 
234 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  27.69 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  27.69 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  27.23 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  27.15 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  28.63 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  23.71 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  24.26 
 
 
279 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  29.28 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  25.63 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  27.11 
 
 
231 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  25.63 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  26.94 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  25.63 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  27.18 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  25.1 
 
 
242 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 
240 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  26.46 
 
 
222 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  25.83 
 
 
266 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  24.41 
 
 
316 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  24.41 
 
 
240 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  24.41 
 
 
346 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  24.41 
 
 
346 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  24.41 
 
 
344 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  24.41 
 
 
336 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  27.41 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  28.34 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  25.36 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24.87 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  26.46 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  25.62 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  27.52 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  25.42 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  25.81 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  23.35 
 
 
227 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  25.71 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  27.89 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  26.32 
 
 
222 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  25.79 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  24.4 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  24.79 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  24.3 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  26.15 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.12 
 
 
239 aa  48.9  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  26.97 
 
 
240 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  23.67 
 
 
233 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  23.67 
 
 
233 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  24.69 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  26.57 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  28.78 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  28 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  19.81 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  21.9 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  20.39 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  29.21 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  34.55 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>