121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0045 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  100 
 
 
236 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  71.18 
 
 
241 aa  330  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  66.81 
 
 
232 aa  315  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  52.38 
 
 
238 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  52.17 
 
 
239 aa  239  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  54.98 
 
 
237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  53.36 
 
 
237 aa  238  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  52.52 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  52.84 
 
 
248 aa  231  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  51.97 
 
 
237 aa  231  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  52.81 
 
 
236 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  51.71 
 
 
236 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  49.34 
 
 
243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  48.5 
 
 
243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  49.57 
 
 
266 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  51.35 
 
 
237 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  35.37 
 
 
242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  32.62 
 
 
241 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  39.13 
 
 
231 aa  121  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  31.11 
 
 
223 aa  118  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  34.51 
 
 
247 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  31.3 
 
 
243 aa  105  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  31.56 
 
 
297 aa  105  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  30.17 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 
222 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  26.67 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  29.56 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  26.15 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  29.5 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  27.56 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  27.56 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  27.11 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  27.11 
 
 
222 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  25.64 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  27.11 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  25.88 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  23.61 
 
 
279 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  26.02 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  26.09 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  26.46 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  27.5 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  27.14 
 
 
239 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  23.86 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  27.32 
 
 
222 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  25.7 
 
 
346 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  25.7 
 
 
346 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  25.7 
 
 
344 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  25.7 
 
 
336 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  25.7 
 
 
316 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  26.18 
 
 
234 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  26.03 
 
 
240 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  27.08 
 
 
234 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  33.09 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  27.64 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  26.5 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  27.23 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  27.39 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  25.62 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  24.39 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  25.23 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  22.67 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  24.51 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  25.75 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  25.12 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  23.9 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  33.11 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  24.55 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  25.35 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  25.57 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  28.3 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  23.92 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  27.88 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  29.81 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  24.3 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  26.42 
 
 
234 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  26.44 
 
 
221 aa  48.9  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  25.25 
 
 
221 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  24.23 
 
 
233 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  24.23 
 
 
241 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  23.79 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  26.57 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  24.4 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  32.37 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  24.39 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  24.39 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  24.87 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  25.38 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  24.28 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>