251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3998 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  100 
 
 		 239 aa  487  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  76.39 
 
 		 241 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  73.19 
 
 		 242 aa  360  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  69.75 
 
 		 242 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 		 241 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  54.51 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  54.7 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  55.93 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  58.47 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  57.02 
 
 		 346 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  57.02 
 
 		 346 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  56.78 
 
 		 336 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  57.02 
 
 		 344 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  56.78 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  51.91 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  56.78 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  52.3 
 
 		 266 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  52.3 
 
 		 266 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  51.88 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  48.96 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 		 266 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  50.21 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  51.29 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  51.29 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  51.28 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  62.38 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  62.38 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  46.64 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  48.13 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  50 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  52.32 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  46.98 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  48.95 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  46.98 
 
 		 241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  45.92 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  48.73 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  61.49 
 
 		 149 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  45.87 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  43.28 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  44.64 
 
 		 233 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  41.63 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  42.06 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  38.14 
 
 		 263 aa  144  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  37.34 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  34.05 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  30.9 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  31.19 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  31.43 
 
 		 230 aa  92  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  28.29 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  30.39 
 
 		 251 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  54.17 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  29.13 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.89 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.89 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  26.34 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  36.5 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  24.39 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  42.72 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  23.38 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  27.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  32.52 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.1 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.86 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  26.21 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  35.09 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  28.87 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  28.87 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24.12 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.19 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  29.03 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  30.72 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.94 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  28.45 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  27.2 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  23.65 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  28.45 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  28.36 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  32.2 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  27.14 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  26.75 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  23.53 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  26.04 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  33.95 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  22.84 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  38.24 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  26.26 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  28.9 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  26.53 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  24.15 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  26.63 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  27.05 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  29.82 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  24.52 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02344  Cryptic haloacid dehalogenase 1  37.23 
 
 		 123 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.906915  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.05 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  26.42 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>