More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5721 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 234 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  45.29 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  36.65 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  31.39 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  35.75 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  40.85 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  34.72 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  31.28 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  31.22 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  31.22 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  31.22 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  27.96 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  30.05 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  32.43 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  31.61 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4869  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.5 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172996  normal  0.422737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  30.2 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  26.73 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  30.35 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  40.15 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  36.2 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00870  haloacid dehalogenase, putative  29.76 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  28.36 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  26.24 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  26.55 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  28.22 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  29.9 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  30.96 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  28.36 
 
 		 228 aa  72  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  27.72 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  28.42 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  33.7 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  24.43 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  29.69 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  24.47 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02344  Cryptic haloacid dehalogenase 1  34.95 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.906915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  36.36 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  29.81 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  33.65 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  36.03 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  35.29 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  35.29 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  29.01 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  32.86 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  37.17 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  26.51 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  31.49 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  31.48 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  29.46 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  36.5 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  30.19 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  32.93 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  31.29 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  27.98 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  29.46 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  31.29 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  30.39 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  24.54 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  28.78 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07918  2-haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05870)  25.85 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  31.71 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  36.84 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  27.37 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  28.72 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  28.03 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  32.92 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  28.99 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  31 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  29.19 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  29.19 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  31 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  32.17 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  33.61 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  24.62 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.09 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  33.65 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  32.58 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  28.71 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  27.33 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  39.81 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  26.11 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  28.81 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  36.09 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  28.81 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  27.49 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  28.81 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  34.03 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  28.66 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  29.78 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  29.78 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  35.65 
 
 		 149 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>