233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2786 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  73.03 
 
 		 241 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  71.91 
 
 		 242 aa  357  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  66.81 
 
 		 239 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 		 242 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  54.94 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  54.94 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  48.5 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  51.06 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  48.93 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  45.11 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  47.01 
 
 		 235 aa  221  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  48.95 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  46.22 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  46.64 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  46.22 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  46.64 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  49.58 
 
 		 336 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  49.58 
 
 		 316 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 		 346 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 		 346 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  49.58 
 
 		 240 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  46.22 
 
 		 240 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  46.47 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  44.54 
 
 		 240 aa  214  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  42.98 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  47.26 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  53.47 
 
 		 203 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  46.03 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  53.47 
 
 		 203 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  43.1 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  46.38 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  43.83 
 
 		 241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  43.4 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  42.24 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  44.9 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  42.31 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  47.83 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  43.35 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  44.44 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  52.08 
 
 		 149 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  39.91 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  40.76 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  37.08 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  36.12 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  31.72 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  32.87 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  29.06 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  29.13 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  48.72 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  29.61 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  25.35 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  28 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.64 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  27.19 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.64 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  27.16 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  26.85 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  29.38 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  26.85 
 
 		 230 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  40 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  22.05 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  26.03 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  28.14 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  28.05 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  28.05 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  27.64 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  29.05 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  23.53 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  27.16 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  32.58 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  27.95 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.07 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.87 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.03 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  26.37 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  25.36 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  24.89 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  25.36 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0192  beta-phosphoglucomutase  26.34 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.787129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  26.21 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  26.21 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  35.85 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  28.86 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  23.76 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4343  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  26.02 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  26.02 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  25.55 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  26.83 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  25.55 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  26.87 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>