More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0969 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  100 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  74.66 
 
 		 224 aa  327  9e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  66.51 
 
 		 223 aa  278  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  67.79 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  59.7 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  34.29 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  37.5 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  32.88 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  38.24 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.21 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  39.42 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  31.63 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  31.55 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  27.86 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.47 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  28.1 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  30.54 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  20.31 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  27.23 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  29.84 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  29.84 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  31.48 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  31.02 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  29.65 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  29.65 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  29.2 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  29.2 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  29.2 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  29.2 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  29.2 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  34.82 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  32.32 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  33.64 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  28.65 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  31.09 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  32.03 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  32.77 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  33.64 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  32.77 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  23.68 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  37.74 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  40.91 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  28 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.03 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  25.7 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  31.93 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  28.7 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  38.18 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  28.14 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.68 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  32.73 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  26.22 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  28.28 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  30.1 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  32.5 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  29.29 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  20.74 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  28.72 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  26.21 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  30.63 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.02 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  31.25 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  25.56 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.12 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  25.14 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  31.93 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  24.35 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  25.52 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  25.52 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  31.29 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  31.29 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  25.73 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  31.29 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  28.12 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  28.12 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  28.12 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  29.38 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  31.71 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  30.09 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  31.94 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  31.01 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  36.54 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  24.21 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.89 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  26.56 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  30.58 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  28.26 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  28.17 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  30.58 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>