More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5968 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  58.65 
 
 		 224 aa  230  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  59.7 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  57.92 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  56.5 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  31.22 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  30.91 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  32.28 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  31.16 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  30.48 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  30.48 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  30.48 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  31.63 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  31.63 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  30.48 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32600  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.98 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  30.81 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  24.12 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  30.88 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  28.86 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  33.87 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  31.68 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  30.35 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  26.4 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  29.27 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  26.4 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  29.09 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  34.41 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  27.86 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  33.14 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  37.61 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  27.94 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.4 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  29.09 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  25 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  30.56 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.95 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  32.77 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  29.08 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  30.58 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  35.96 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  36.89 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  31.15 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  32.84 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  25.84 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  27.44 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  30.2 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  25.84 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  42.39 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  34.07 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  26.21 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  29.65 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.83 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  31.15 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.58 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  24.08 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  36.07 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  25.55 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  31.01 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  26.26 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  37.37 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.08 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  29.9 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  37.37 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  27.85 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  23.04 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  24.26 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.92 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  26.21 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.93 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.88 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  26.92 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  26.21 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3178  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.69 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00001464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  30.1 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  26.53 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  36.36 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  25.79 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  36.89 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  27.37 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  27.46 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  24.1 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.49 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02361  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_5G14640)  25.12 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>