More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0824 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  70.37 
 
 
220 aa  322  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  66.2 
 
 
229 aa  301  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  64.15 
 
 
220 aa  280  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  58.06 
 
 
219 aa  257  8e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  55 
 
 
225 aa  250  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  55.76 
 
 
220 aa  244  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  45.16 
 
 
217 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  43.06 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.98 
 
 
217 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.67 
 
 
218 aa  181  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.74 
 
 
221 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.57 
 
 
217 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.89 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  39.09 
 
 
224 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  38.71 
 
 
216 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.56 
 
 
218 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  38.5 
 
 
218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.96 
 
 
217 aa  137  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  35.21 
 
 
218 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.18 
 
 
217 aa  132  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.32 
 
 
216 aa  131  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.74 
 
 
218 aa  122  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.4 
 
 
216 aa  112  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.05 
 
 
219 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  35.98 
 
 
224 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 
228 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  32.81 
 
 
225 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  32.32 
 
 
225 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1983  Phosphoglycolate phosphatase  33.99 
 
 
257 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  31.77 
 
 
225 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.51 
 
 
233 aa  103  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  32.13 
 
 
235 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 
226 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 
226 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  35.38 
 
 
229 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33 
 
 
222 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
241 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
241 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
241 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  30.52 
 
 
231 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 
218 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
241 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  33.68 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  31.05 
 
 
225 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.81 
 
 
216 aa  98.6  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  34.39 
 
 
230 aa  98.6  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
461 aa  98.2  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.44 
 
 
222 aa  98.2  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  30.19 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  33.95 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
227 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
235 aa  95.9  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.39 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  34.39 
 
 
223 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  30.19 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  34.39 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 
229 aa  95.1  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  34.21 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  31.03 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  34.21 
 
 
224 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  34.3 
 
 
223 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
222 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  33.86 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
226 aa  92.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  34.21 
 
 
224 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  30.5 
 
 
272 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  30.5 
 
 
272 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
272 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 
227 aa  92  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 
232 aa  92  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
227 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  30.5 
 
 
272 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
223 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  27.06 
 
 
225 aa  91.7  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  28.11 
 
 
226 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  28.11 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 
272 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  31.05 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  32.78 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  31.63 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>