211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3684 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  72.43 
 
 		 242 aa  359  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  68.49 
 
 		 255 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  70.04 
 
 		 225 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  63.07 
 
 		 236 aa  291  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  64.14 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  53.71 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  53.71 
 
 		 232 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  53.71 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  52.4 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  51.74 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  48.71 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  45.66 
 
 		 270 aa  208  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  46.36 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  46.03 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  46.75 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  50 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  45.19 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  44.77 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  44.77 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  45.65 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  48.6 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  48.6 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  44.78 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  44.78 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  48.6 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  48.6 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  48.6 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  48.6 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  48.13 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  43.16 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  44.02 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  43.35 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  39.63 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  39.63 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  37.34 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  42.13 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  41.05 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  40.49 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  40.71 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  43.18 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  42.72 
 
 		 224 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  34.02 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  39.56 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  38.6 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  39.56 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  40.72 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  43.2 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  42.72 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  40 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  38.82 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  36.51 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  39.48 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  38.24 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  40.28 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  29.74 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  29.07 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  30.49 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  33 
 
 		 222 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  30.83 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  31.3 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  30.18 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02361  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_5G14640)  30.33 
 
 		 237 aa  89  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  28.83 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  29.22 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  26.48 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  26.87 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  26.58 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  26.58 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  29.78 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  28.06 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  29.28 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.61 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  29.79 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  25.43 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  23.94 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  30.54 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  23.5 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  27.94 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  25.43 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  23.94 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  24.45 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  26.67 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  23.88 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  25.23 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  25.4 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  26.22 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  26.48 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  24.19 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  26.48 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  27.67 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  21.12 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  27.96 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>