202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2046 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 227 aa  471  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  87.38 
 
 		 237 aa  397  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  53.6 
 
 		 242 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  50.62 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  46.22 
 
 		 233 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  52.27 
 
 		 239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  53.18 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  49.56 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  45.33 
 
 		 232 aa  228  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  47.56 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  45.33 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  48.71 
 
 		 249 aa  224  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  46.22 
 
 		 262 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  45.5 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  43.78 
 
 		 270 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  41.42 
 
 		 271 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  40.44 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  43.54 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  40 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  40 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  40 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  40 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  39.56 
 
 		 253 aa  191  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  39.56 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  43.54 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  43.54 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  43.54 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  43.54 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  43.54 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  43.54 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  43.06 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  40.28 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  39.81 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  35.4 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  36.49 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  37.73 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  36.2 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  35.29 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  35.29 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  37.27 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  36.99 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  36.36 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  36.62 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  35.96 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  34.78 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  33.83 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  35.55 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  38.61 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  35.75 
 
 		 220 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  35.16 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  30.8 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  35.61 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  34.27 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  37.2 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  34.5 
 
 		 246 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  36.71 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  29.21 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  28.38 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  29.7 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  27.07 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  28.38 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  28.84 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  30.2 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02361  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_5G14640)  29.54 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  25.78 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  27.07 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  27.23 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  26 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  25.12 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.11 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  24.34 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  31.84 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  21.52 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  22.27 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  26.27 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  25.81 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  22.27 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  23.56 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  24.3 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  23.93 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  22.03 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.38 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  23.67 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  23.93 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  28.17 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  23.98 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  23.68 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  26.32 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  21.29 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  28 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  26.06 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  20.75 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02344  Cryptic haloacid dehalogenase 1  25.71 
 
 		 123 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.906915  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  25.44 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  24.03 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  24.03 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.03 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.4 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  24.81 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>