More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6192 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  74.66 
 
 		 225 aa  327  9e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  70.87 
 
 		 223 aa  294  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  68.93 
 
 		 223 aa  284  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  58.65 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  29.95 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  37.16 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  30.18 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  38.28 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  39.06 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  25.33 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.95 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  33 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  27.37 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  28.36 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  30.21 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  27.37 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  29.85 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  30.3 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.37 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.44 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  30.95 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  25.55 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  30.37 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  30.37 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  30.37 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  30.37 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  30.37 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  30.37 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  29.55 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  29.55 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  26.64 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  34.15 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  28.77 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  34.91 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25.71 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  32.64 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  24.11 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  28.46 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  38.32 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  27.57 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  30.21 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  32.89 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  32.89 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  28.74 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  24.75 
 
 		 240 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  33.96 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.57 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  33.61 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  33.61 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  33.61 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  33.61 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  33.61 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  30.09 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  28.7 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  29.81 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  37.96 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  35.34 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  31.1 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  37.96 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  40.43 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  26.18 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  28.89 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  23.98 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  30.39 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  37.96 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  26.18 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  35.34 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  34.58 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  34.58 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  27.16 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  28.06 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  29.8 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  30.35 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  35.71 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  34.48 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  43.14 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  32.77 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  34.58 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.58 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  29.23 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  34.58 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  34.58 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  34.58 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  34.58 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  28.21 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  30.35 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  34.58 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  29.51 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  30.5 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  25.52 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>