292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4708 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  53.88 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  54.94 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  51.72 
 
 		 242 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  51.29 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  49.35 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  46.75 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  50 
 
 		 242 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 346 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 336 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 346 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 344 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 316 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 240 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  46.32 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  50.88 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  44.78 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  47.62 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  47.62 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  46.75 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  51.5 
 
 		 203 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  51.5 
 
 		 203 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  44.83 
 
 		 242 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  46.67 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  47.01 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  48.1 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  45.69 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  45.89 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  44.83 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  46.12 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  46.12 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  45.69 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  45.29 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  44.16 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  46.78 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  46.52 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  39.06 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  43.22 
 
 		 242 aa  161  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  42.49 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  54.74 
 
 		 149 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  42.86 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  42.86 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  42.16 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  34.88 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  32.3 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  29.25 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  23.5 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  23.7 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  29.15 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  25.87 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  43.66 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  29.9 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  29.9 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  28.36 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.48 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  30.1 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  29.81 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  21.85 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  27.78 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  24.27 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  28.92 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  23.56 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  27.27 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  29.25 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.91 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.91 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  28.78 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.18 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  29.13 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  28.14 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  27.72 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.23 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  27.72 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  29.46 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  28.43 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  25.71 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  31.5 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  27.5 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  26.17 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  22.91 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.09 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  23.91 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  28.78 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  26.87 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>