173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4408 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 233 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  84.55 
 
 		 233 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  64.81 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  54.27 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  52.16 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  59.13 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  52.77 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  53.02 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  53.02 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  53.02 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  52.81 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  53.02 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  52.59 
 
 		 266 aa  214  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  50.86 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  50 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  52.38 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  48.73 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  48.73 
 
 		 316 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  46.98 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  48.73 
 
 		 344 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  48.73 
 
 		 336 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  48.73 
 
 		 346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  48.73 
 
 		 346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  46.55 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  46.55 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  45.65 
 
 		 237 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  43.97 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  43.72 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  46.81 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  45.3 
 
 		 240 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  41.45 
 
 		 242 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  40.34 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  45.99 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  44.02 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  40.6 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  44.68 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  43.88 
 
 		 239 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  41.63 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  39.91 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  43.04 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  43.04 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  45.85 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  45.85 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  38.1 
 
 		 232 aa  144  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  51.43 
 
 		 149 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  31.66 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  32.05 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  33.04 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  32.54 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  30.58 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  30.94 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  26.55 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  26.55 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  29.39 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  30.43 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  29.47 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  47.89 
 
 		 99 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  29.47 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  31.05 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  30.77 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.76 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  28.33 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  30.62 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  30.35 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  26.38 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  30.81 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  31.1 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  31.1 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  27.5 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  28.95 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  23.83 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  23.83 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  31.75 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  26.81 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  30.04 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  40.19 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  28.29 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  29.18 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  30.46 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  29.38 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  28.36 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  27.66 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  31.36 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  30.48 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  30.48 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  30.48 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  30.48 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  30.48 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  29.05 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  26.98 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  28.99 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  23.87 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>