215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2963 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 241 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  84.52 
 
 		 242 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  76.39 
 
 		 239 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  73.03 
 
 		 241 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  75.11 
 
 		 242 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  53.88 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  53.88 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  53.33 
 
 		 240 aa  241  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  53.33 
 
 		 316 aa  238  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  53.56 
 
 		 346 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  53.56 
 
 		 346 aa  238  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  53.56 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  53.33 
 
 		 336 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  53.33 
 
 		 240 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  48.96 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  53.22 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  48.95 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  48.95 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  46.58 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  48.52 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  47.86 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  48.1 
 
 		 252 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  48.1 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  44.92 
 
 		 242 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  50.42 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  50.42 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  45.76 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  48.07 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  49.35 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  55.94 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  55.94 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  46.55 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  46.12 
 
 		 241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  47.41 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  44.21 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  45.87 
 
 		 242 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  46.38 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  42.67 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  44.1 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  55.41 
 
 		 149 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  40.34 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  41.28 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  40.77 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  40.43 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  36.56 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  29.27 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  28.71 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  30.54 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  31.06 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  30.38 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  52.63 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  28.71 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  26.25 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  24.2 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  28.25 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  40.35 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  27.35 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  33.09 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  24.42 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  26.32 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  33.61 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  26.87 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  25 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.94 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  26.09 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  28.75 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  28.75 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  21.39 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  33.64 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  28.33 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  28.33 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  25.79 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  25.34 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  25.48 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  27.92 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24.41 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  26.57 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  28.9 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.7 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  25.48 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  21.46 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  21.57 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  28.38 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.11 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  34.11 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  23.31 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  25.48 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  30.88 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  25.48 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  25.48 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  25.96 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0403  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.96 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  25.6 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  28.21 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  24.5 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>