121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6581 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  100 
 
 		 236 aa  487  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  93.22 
 
 		 237 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  91.1 
 
 		 237 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  66.38 
 
 		 243 aa  325  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  67.26 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  64.29 
 
 		 243 aa  299  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  51.71 
 
 		 236 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  48.71 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  47.68 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  43.46 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  45.73 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  43.29 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  41.45 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  41.81 
 
 		 237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  41.45 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  41.33 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  36.91 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  39.3 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  36.73 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  36.63 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  35.06 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  31.56 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  34.91 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  29.87 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  30.47 
 
 		 223 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  27.11 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  28.24 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  28.12 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  30.1 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  30.1 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  23.86 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  26.83 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  30.2 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  25.48 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  27.13 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  27.13 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  26.44 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  31.5 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  28.77 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  24.5 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  26.67 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  28.14 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  24.79 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  30.48 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  26.7 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.29 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.97 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  28.12 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  28.12 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0145  hypothetical protein  26.14 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 		 346 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 		 346 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 		 344 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 		 336 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  28.92 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  24.24 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  25.73 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  26.26 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  25.25 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  24.76 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  26.26 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.55 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  23.77 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  23.32 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  25.37 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  28.03 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  28.03 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  30.4 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  28.05 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  25.37 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  24.76 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 249 aa  45.1  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  28.15 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  24.75 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  27.62 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  30.43 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.32 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  26.07 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  26.64 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>