177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3076 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 
222 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  67.12 
 
 
222 aa  333  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  66.67 
 
 
222 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  66.67 
 
 
222 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  66.67 
 
 
222 aa  331  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  66.67 
 
 
222 aa  331  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  63.06 
 
 
222 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  64.13 
 
 
222 aa  315  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  63.23 
 
 
222 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  63.06 
 
 
222 aa  309  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  61.71 
 
 
222 aa  309  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  61.26 
 
 
222 aa  308  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  64.09 
 
 
221 aa  307  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  61.71 
 
 
222 aa  306  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  63.06 
 
 
222 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  63.18 
 
 
221 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  61.26 
 
 
222 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  61.54 
 
 
223 aa  300  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  61.26 
 
 
222 aa  299  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  62.27 
 
 
221 aa  298  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  60.81 
 
 
222 aa  295  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  59.09 
 
 
234 aa  295  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  59.01 
 
 
222 aa  295  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  59.46 
 
 
222 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  59.46 
 
 
222 aa  287  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  60.81 
 
 
222 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  53.12 
 
 
224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  32.43 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  33.76 
 
 
231 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  29.78 
 
 
242 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  31.07 
 
 
235 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  32.18 
 
 
223 aa  91.7  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  32.67 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  25.38 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  29.46 
 
 
234 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  29.02 
 
 
234 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
241 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  28.08 
 
 
234 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.2 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  29.44 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  28.08 
 
 
234 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.93 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  27.04 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  25.78 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.54 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  26.61 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  30.29 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  30.29 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.47 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  29.56 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.93 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  29.36 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  32.28 
 
 
243 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  25.77 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  26.01 
 
 
234 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  29.19 
 
 
243 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.18 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  26.43 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.19 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  24.89 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.35 
 
 
237 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  24.1 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  27.05 
 
 
266 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  28.3 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  25.13 
 
 
230 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  26.51 
 
 
256 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  26.64 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  34.4 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  26.27 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  31.54 
 
 
235 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1501  hydrolase  37.88 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.401129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  28.23 
 
 
253 aa  52  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  24.68 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  28.63 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  27.71 
 
 
266 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  27.71 
 
 
266 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  25 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.71 
 
 
244 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.67 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  25.95 
 
 
233 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  26.4 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.03 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  23.5 
 
 
241 aa  48.9  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  23.83 
 
 
241 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  25.35 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  27.68 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  23.19 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  24.02 
 
 
239 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  24.54 
 
 
240 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  23.68 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  23.68 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  27.66 
 
 
245 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  25.21 
 
 
239 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  25.25 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>