111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1921 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  68.42 
 
 		 237 aa  330  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  70.61 
 
 		 237 aa  328  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  71.95 
 
 		 237 aa  321  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  65.94 
 
 		 239 aa  317  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  69.87 
 
 		 238 aa  315  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  64.76 
 
 		 266 aa  305  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  52.81 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  53.45 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  52.38 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  48.21 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  45.98 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  44.16 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  44.16 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  43.72 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  41.88 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  35.32 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  36.48 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  30 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  30 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  31.25 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  32.75 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  26.18 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  28.28 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  28.28 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  29.33 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  28 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  25.94 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  24.75 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  25.25 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  25.47 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  27.01 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  23.47 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  26.92 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  25.49 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  28.3 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  26.29 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  25.42 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  23.98 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  26.27 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  26.92 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  26.27 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  24.51 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  24.75 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  23.32 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  25.38 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  22.45 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  23.53 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  30.15 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  24.75 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  24.75 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  30.15 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  24.87 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  27.74 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  24.62 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  21.9 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  21.9 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  24.37 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  21.9 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  26.72 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  23.53 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  22.41 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  28.21 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  23.53 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  22.08 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.28 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.71 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  23.53 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  23.53 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  22.38 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  28.67 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  22.37 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  30 
 
 		 249 aa  45.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  22.55 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  28.48 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  28.48 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  23.04 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  23.92 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  23.19 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  26.13 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  24.38 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  21.07 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.79 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  27.72 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  34.31 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  21.29 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  22.44 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>