100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5007 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  100 
 
 		 237 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  87.76 
 
 		 237 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  82.63 
 
 		 237 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  72.15 
 
 		 239 aa  358  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  75.42 
 
 		 238 aa  352  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  66.52 
 
 		 266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  72.37 
 
 		 236 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  52.38 
 
 		 236 aa  234  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  52.99 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  50.87 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  49.12 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  44.35 
 
 		 243 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  42.49 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  42.74 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  43.28 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  42.74 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  35.65 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  31.14 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  29.66 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  32.31 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  30.74 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  30.74 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  30.24 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  28.26 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  28.7 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  27.94 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  31.07 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  31.07 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  30.58 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  30.58 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  30.58 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  27.83 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  30.81 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  27.6 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  28.51 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  28.16 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  29.76 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  29.58 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  28.11 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  27.14 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  27.59 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  27.63 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.57 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  27.5 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  26.11 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  25.76 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  24.9 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  24.89 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  25.13 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  26.09 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  26.11 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.33 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  24.68 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.24 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  25.1 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  23.88 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  23.88 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  23.01 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  24.24 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  23.18 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  23.18 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  25.1 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  24.59 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  33.58 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  28.03 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  24.52 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  24.19 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  23.32 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  25 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2941  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  26.9 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.608809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  25.66 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  26.14 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  23.48 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  23.48 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  25.48 
 
 		 222 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  23.65 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  31.37 
 
 		 217 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.46 
 
 		 233 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  25.93 
 
 		 256 aa  42  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 225 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  23.65 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  24.5 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  24.5 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>