163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0250 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  84.3 
 
 		 225 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  39.44 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  40.28 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  35.42 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  38.14 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  37.05 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  35.5 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  33.63 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  33.19 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  34.69 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  34.98 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  32.34 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  32.67 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  32.67 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  32.67 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  32.67 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  34.31 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  34.31 
 
 		 297 aa  93.6  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  32.18 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  32.18 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  31.33 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  32.34 
 
 		 237 aa  88.2  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  30.47 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  32.34 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  29.91 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  30.81 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  29.19 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  32.84 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  29.68 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  30.2 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  31.66 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  28.97 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  29.7 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  27.07 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  32.84 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  29.36 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  26.64 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  28.79 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.71 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  29.76 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  27.91 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.85 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  30.1 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.88 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  27.23 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  29.44 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  29.47 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  28.29 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  27.06 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.65 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  27.8 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  27.06 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  29.91 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  26.7 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  32.28 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  25.15 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  26.91 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  25.55 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  24.7 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  29.76 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  25.69 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  25.13 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  23.68 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  25.33 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  36.26 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  29.73 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  28.08 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  28.08 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  27.75 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  29.28 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  24.44 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.31 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  27.05 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  25.55 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  28.04 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  26.98 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  26.57 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  27.68 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  31.45 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  29.81 
 
 		 263 aa  49.3  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  25.24 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  28.84 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  28.84 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>