More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3660 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  100 
 
 
234 aa  480  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  54.29 
 
 
218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  50.22 
 
 
233 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  50.22 
 
 
233 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  49.57 
 
 
245 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  52.63 
 
 
215 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  51.9 
 
 
217 aa  224  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  46.51 
 
 
217 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.39 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  28.57 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.85 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  34.45 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41148  predicted protein  24.78 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  26.14 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  25.32 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1511  HAD family hydrolase  30.51 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  41.94 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15870  predicted protein  25.1 
 
 
282 aa  68.6  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296862  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.63 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  30.83 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  28 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.62 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.3 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.26 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0949  HAD family hydrolase  29.67 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60922  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  35.19 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  35.61 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  34.65 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  26.99 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  38.55 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  39.8 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.32 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01740  hypothetical protein  29.53 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  34.86 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  37.07 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  36.11 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.27 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  38.71 
 
 
225 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  38.71 
 
 
225 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  38.71 
 
 
225 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.71 
 
 
225 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  38.71 
 
 
225 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  36.63 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  38.71 
 
 
225 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  33.96 
 
 
231 aa  62.4  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
222 aa  62.4  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  36.11 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  36.11 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  36.11 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  38.71 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  38.71 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  41.11 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  29.52 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  35 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  33.62 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.51 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  32.71 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.71 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.16 
 
 
233 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.58 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  36.96 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  41.11 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3426  hypothetical protein  26.71 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.045465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  35.71 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  37.33 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.42 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  29.25 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  33.94 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  38.71 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  40 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  22.82 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5896  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.96 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  40 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  40 
 
 
230 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  28.49 
 
 
230 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  35.16 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  35 
 
 
232 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  32.8 
 
 
224 aa  58.9  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  35.87 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3166  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  30.15 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0542047  hitchhiker  0.0000136162 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  35.87 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  35.87 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  35.87 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  35.87 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  36.96 
 
 
224 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  37.23 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  23.26 
 
 
225 aa  58.5  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  23.26 
 
 
225 aa  58.5  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  32.32 
 
 
233 aa  58.5  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.17 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  29.37 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  46.58 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  34.34 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  36.04 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.17 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>