282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2373 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  100 
 
 
253 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  90.75 
 
 
228 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3166  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  49.26 
 
 
209 aa  184  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0542047  hitchhiker  0.0000136162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.08 
 
 
232 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  44.54 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  44.54 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  44.54 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  46.52 
 
 
228 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0949  HAD family hydrolase  43.53 
 
 
235 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60922  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  42.54 
 
 
228 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.01 
 
 
230 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.09 
 
 
230 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1991  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.04 
 
 
219 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  38.64 
 
 
203 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  31.47 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  35.29 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.21 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  41.56 
 
 
292 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  32.74 
 
 
233 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.18 
 
 
230 aa  59.3  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  26.13 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  37.39 
 
 
245 aa  58.9  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  43.56 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  42.2 
 
 
286 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  33.02 
 
 
218 aa  58.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  43 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  37.93 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.61 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  29.73 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  37.76 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  33.09 
 
 
220 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  24 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  34.38 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.27 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  28.17 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  42 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  34.69 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  42 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  42 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  42 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  40.38 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  25.93 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  40.38 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  30.48 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.87 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.52 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  36.73 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.71 
 
 
227 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  30.57 
 
 
231 aa  52.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  30.48 
 
 
217 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  39.56 
 
 
257 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  33.33 
 
 
245 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.33 
 
 
218 aa  52.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  32.62 
 
 
238 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  36.73 
 
 
221 aa  52  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  42.57 
 
 
217 aa  52  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172111  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 
227 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  29.28 
 
 
233 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3178  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.25 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00001464  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.94 
 
 
220 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  37.86 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2362  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.56 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  32.5 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.48 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  30.54 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
221 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  35.14 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.38 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  33.06 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  33.04 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  33.72 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.43 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  39 
 
 
242 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  39 
 
 
242 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  41.49 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  39 
 
 
242 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  39 
 
 
242 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.86 
 
 
261 aa  49.3  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  28.11 
 
 
244 aa  49.3  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  35.23 
 
 
230 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  39 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  30.34 
 
 
224 aa  49.7  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.02 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  39 
 
 
245 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  39 
 
 
245 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  37.5 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0025  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.8 
 
 
209 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  34.26 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  33.09 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  40.51 
 
 
215 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
227 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  32.03 
 
 
199 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 
229 aa  48.9  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.83 
 
 
251 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  34.17 
 
 
499 aa  48.9  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.62 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  22.16 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>