More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0176 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 224 aa  465  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  51.12 
 
 		 233 aa  228  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  49.78 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  48.65 
 
 		 234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  52.07 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  48.2 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  45.06 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  45.06 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  45.06 
 
 		 252 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  45.06 
 
 		 252 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  45.5 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  44.64 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  44.44 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  49.78 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  49.78 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  49.78 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  47.27 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  44.93 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  44.93 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  44.73 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  44.73 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  44.93 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  44.73 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  46.58 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  45.61 
 
 		 252 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  47.06 
 
 		 227 aa  194  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  45.18 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  44.74 
 
 		 252 aa  191  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  45.45 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  42.34 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  47.27 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  44.84 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  45.16 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  44.29 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  44.95 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  44.29 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  44.09 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  43.84 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  43.81 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  43.56 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  44.95 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  43.98 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  44.04 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  44.04 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  44.04 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  43.12 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  38.81 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 		 226 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 		 272 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  38.07 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  38.07 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 		 272 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  38.07 
 
 		 272 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  38.64 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  38.07 
 
 		 272 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  39.35 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  38.07 
 
 		 272 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  37.16 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  36.99 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  36.99 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  37.16 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  36.16 
 
 		 226 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  36.11 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  37.22 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  37.22 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  40.4 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  37.33 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  35.22 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  34.29 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  34.42 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  35.93 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  32.24 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 		 261 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  34.47 
 
 		 233 aa  124  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  30.87 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>