More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3193 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
250 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  46.43 
 
 
227 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  42.53 
 
 
226 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  40.74 
 
 
229 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 
226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  41.47 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  39.42 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  41.43 
 
 
231 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  40.87 
 
 
227 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 
225 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  41.03 
 
 
233 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  39.42 
 
 
228 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  40.84 
 
 
234 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  40.31 
 
 
234 aa  145  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 
229 aa  145  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  38.54 
 
 
225 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  41.26 
 
 
238 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  35.21 
 
 
225 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  39.25 
 
 
225 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  38.18 
 
 
230 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  40.4 
 
 
461 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 
236 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  40.2 
 
 
216 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 
233 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  39.19 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  38.35 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  39.72 
 
 
226 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  38.35 
 
 
272 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  41.26 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  37.79 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  39.02 
 
 
225 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
238 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  40.81 
 
 
233 aa  138  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  39.9 
 
 
214 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 
228 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
235 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
227 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
228 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 
235 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.22 
 
 
222 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  39.72 
 
 
227 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  36.97 
 
 
227 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  36.07 
 
 
223 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 
226 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  39.23 
 
 
232 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  36.71 
 
 
272 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 
233 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  35.02 
 
 
217 aa  134  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  39.25 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  42.64 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  41.75 
 
 
221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.3 
 
 
222 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  37.21 
 
 
234 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  39.71 
 
 
223 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  39.51 
 
 
225 aa  132  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 
227 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  39.25 
 
 
227 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.32 
 
 
232 aa  132  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 
234 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  35.92 
 
 
266 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  35.55 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  39.73 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  36.94 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  38.21 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  39.27 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  39.27 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  37.68 
 
 
226 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  34.6 
 
 
272 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  41.15 
 
 
218 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  35.07 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  34.42 
 
 
225 aa  129  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  39.7 
 
 
250 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  39.29 
 
 
233 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  39.27 
 
 
225 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 
229 aa  128  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  35.57 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  36.14 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  37.7 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  38.68 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  40.61 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  37.96 
 
 
226 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 
228 aa  125  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 
231 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 
228 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  40.38 
 
 
232 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  35.87 
 
 
232 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 
242 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 
242 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 
242 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 
245 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>