More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0877 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  68.22 
 
 		 232 aa  308  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  56.42 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  55.05 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  54.38 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  53.81 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  52.02 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  51.57 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  48.1 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  46.58 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  47.47 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  47.14 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  45.05 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  48.57 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  45.67 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  45.62 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  46.98 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  46.95 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  46.51 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  47.03 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  44.76 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  44.98 
 
 		 461 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  46.61 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  39.19 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  40.87 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  38.89 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  36.14 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  36.11 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  41.88 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  35.94 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  35.65 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  35.02 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  36.82 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  37.57 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  34.12 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  35.71 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  37.91 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 		 234 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.48 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  35.9 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  33.81 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  36.02 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  38.21 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  32.38 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  36.46 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  37.02 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  35.55 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  37.02 
 
 		 272 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  35.55 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  36.7 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 		 272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  35.64 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  36.92 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  35.21 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  35.47 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  32.38 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  32.38 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  32.24 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 272 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 		 229 aa  104  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  34.02 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  39.06 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  35.18 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  33.81 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  33.81 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  32.21 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  34.52 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>