More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3219 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 232 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  52.94 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  54.88 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  53.64 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  51.72 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  54.34 
 
 		 231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  52.04 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  48.9 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  49.33 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  47.35 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  47.35 
 
 		 234 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  46.9 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  48.71 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  46.36 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  46.61 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  49.11 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  49.55 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  53.59 
 
 		 461 aa  197  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  48.66 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  48.08 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  46.15 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  54.59 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  53.67 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  44.44 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  45.66 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  44.34 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  46.92 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  40.48 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  44.81 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  44.95 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 		 226 aa  148  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  45.73 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  40.27 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  41.04 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  39.82 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  40.57 
 
 		 272 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  41.35 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  42.49 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  39.05 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.66 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  39.63 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  42.44 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  39.53 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  39.01 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  38.81 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  38.71 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 223 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  38.83 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  39.55 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  39.52 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.74 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  39.78 
 
 		 218 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  39.55 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  37.19 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.39 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  39.27 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  40.2 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  36.22 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  40.83 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  39.41 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  33.5 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  35.41 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  36.68 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  34.84 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  39.01 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  37.07 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  36.68 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  36.44 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  37.69 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  34.39 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  38.54 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  35.9 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  43.43 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  34.88 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  36.67 
 
 		 218 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  36.92 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  36.92 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  36.92 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  34.29 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  39.91 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>