More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00083 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
228 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  88.16 
 
 
228 aa  403  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  75.56 
 
 
226 aa  345  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  62.05 
 
 
227 aa  295  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  49.32 
 
 
235 aa  205  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  49.11 
 
 
227 aa  204  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  49.32 
 
 
227 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  47.96 
 
 
226 aa  202  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  49.77 
 
 
227 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
252 aa  201  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  47.91 
 
 
272 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  48.86 
 
 
227 aa  201  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
252 aa  201  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
252 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  47.91 
 
 
272 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
252 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
252 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  47.49 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  47.84 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  49.32 
 
 
225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
252 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
252 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  47.41 
 
 
252 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
252 aa  198  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
252 aa  198  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
252 aa  198  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  47.44 
 
 
272 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
252 aa  198  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  48.86 
 
 
225 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  48.86 
 
 
225 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  48.61 
 
 
227 aa  198  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  48.61 
 
 
232 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  48.86 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  47 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  45.7 
 
 
272 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  46.05 
 
 
272 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  46.51 
 
 
226 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  46.9 
 
 
231 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  46.05 
 
 
266 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  45.12 
 
 
272 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  45.95 
 
 
233 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  49.32 
 
 
228 aa  191  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  46.51 
 
 
272 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  45.42 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  45.29 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  46.76 
 
 
233 aa  188  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  43.56 
 
 
224 aa  188  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  44.84 
 
 
234 aa  187  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  46.15 
 
 
232 aa  185  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  46.15 
 
 
232 aa  185  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  46.15 
 
 
232 aa  185  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  45.98 
 
 
232 aa  181  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  45.18 
 
 
225 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  46.98 
 
 
232 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  42.25 
 
 
225 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  43.42 
 
 
227 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  42.53 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  44.84 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  41.26 
 
 
232 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  41.55 
 
 
230 aa  166  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  43.52 
 
 
223 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  41.41 
 
 
227 aa  164  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  40.81 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  41.44 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  39.64 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 
229 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  41.12 
 
 
226 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  43.19 
 
 
229 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  38.12 
 
 
227 aa  155  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  36.99 
 
 
223 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 
227 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 
227 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  36.52 
 
 
241 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  37.85 
 
 
227 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 
256 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 
226 aa  142  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 
227 aa  141  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  39.53 
 
 
227 aa  141  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  37.16 
 
 
233 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 
242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
228 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
261 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  38.36 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
240 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  36.23 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  36.53 
 
 
254 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 
251 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  36.07 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  37.27 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  36.07 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  36.07 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 
250 aa  132  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
226 aa  131  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  34.84 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>