More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0230 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  71.86 
 
 		 234 aa  340  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  70.13 
 
 		 234 aa  337  8e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  69.7 
 
 		 232 aa  332  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  74.14 
 
 		 232 aa  332  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  69.96 
 
 		 233 aa  325  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  61.6 
 
 		 252 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  61.6 
 
 		 252 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  61.6 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  61.6 
 
 		 252 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  60.48 
 
 		 252 aa  294  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  60.48 
 
 		 252 aa  293  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  60.48 
 
 		 252 aa  293  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  60.08 
 
 		 252 aa  293  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  60.48 
 
 		 252 aa  293  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  60.08 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  60.08 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  60.08 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  60.08 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  60.24 
 
 		 252 aa  292  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  59.44 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  49.78 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  43.75 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  47.98 
 
 		 227 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  45.54 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  44.34 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  45.16 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  45.25 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  45.16 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  46.26 
 
 		 227 aa  191  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  45.16 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  45.25 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  47.77 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  48.87 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  45.16 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  44.8 
 
 		 226 aa  187  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  45.25 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  45.5 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  47.22 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  46.15 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  43.38 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  43.56 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  44.84 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  46.4 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  48.85 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  48.39 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  45.95 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  45.95 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  45.33 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  38.67 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  44.86 
 
 		 266 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  45.83 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  46.76 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  40.62 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  45.12 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  42.41 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  44.75 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  41.44 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  44.44 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  40.76 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  41.94 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  44.24 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  40.1 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  37.26 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  36.92 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  38.68 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  36.84 
 
 		 257 aa  138  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  38.28 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  36.7 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  36.91 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  37.91 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  35.27 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  35.53 
 
 		 225 aa  128  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  41.15 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  37.74 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  40.48 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  35.11 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  35.55 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  38.39 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  37.32 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  32.26 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 		 251 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>