More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2583 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  45.91 
 
 
227 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  45.29 
 
 
225 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  44.34 
 
 
226 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  45.45 
 
 
229 aa  177  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  45 
 
 
227 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  45.02 
 
 
227 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  45 
 
 
227 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  41.18 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  40.91 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  45.83 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  42.4 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  44.55 
 
 
229 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  44.74 
 
 
235 aa  168  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  42.99 
 
 
227 aa  168  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  44.04 
 
 
226 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  42.66 
 
 
232 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  46.91 
 
 
272 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  46.95 
 
 
223 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  37.9 
 
 
225 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  46.67 
 
 
272 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  42.63 
 
 
235 aa  157  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  40.54 
 
 
226 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  44.21 
 
 
231 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  40.81 
 
 
228 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  43.68 
 
 
227 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  43.16 
 
 
226 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  43.16 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  42.63 
 
 
225 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  42.63 
 
 
225 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  42.63 
 
 
225 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  43.94 
 
 
272 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  42.63 
 
 
228 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  43.16 
 
 
227 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  43.43 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  43.16 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  42.63 
 
 
225 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 
226 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  43.59 
 
 
272 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  44.44 
 
 
272 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  44.16 
 
 
272 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  40.36 
 
 
227 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  43.65 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  39.65 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  41.9 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  43.38 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 
225 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 
230 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  39.01 
 
 
242 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  40.68 
 
 
253 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  41.23 
 
 
246 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  42.08 
 
 
216 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  41.7 
 
 
252 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  42.13 
 
 
252 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  42.13 
 
 
252 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  42.13 
 
 
252 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  42.13 
 
 
252 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  42.13 
 
 
252 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  41.7 
 
 
252 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  42.55 
 
 
252 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  42.55 
 
 
252 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  42.55 
 
 
252 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  40.38 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  41.7 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 
224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  39.73 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  41.24 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  41.94 
 
 
232 aa  138  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  39.51 
 
 
234 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 
251 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 
238 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  36.89 
 
 
254 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  41.07 
 
 
246 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  36.89 
 
 
254 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  36.89 
 
 
254 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 
221 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  41.01 
 
 
226 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 
238 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  41.75 
 
 
228 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 
218 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  36.74 
 
 
225 aa  135  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 
233 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 
232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 
218 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  38.43 
 
 
224 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 
230 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  41.74 
 
 
237 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  36.16 
 
 
228 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  39.29 
 
 
237 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 
233 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>