More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0261 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
226 aa  460  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  54.91 
 
 
225 aa  264  8.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  53.85 
 
 
225 aa  241  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  47.75 
 
 
232 aa  211  5.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  48.62 
 
 
230 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  45.87 
 
 
225 aa  207  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  47.3 
 
 
227 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  47.03 
 
 
225 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  45.91 
 
 
225 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  47.06 
 
 
227 aa  201  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  46.12 
 
 
225 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  46.12 
 
 
225 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  45.41 
 
 
227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 
226 aa  198  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  45.87 
 
 
227 aa  197  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  46.92 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  46.88 
 
 
231 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 
224 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  44.95 
 
 
227 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  45.12 
 
 
235 aa  191  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  44.65 
 
 
272 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  47.69 
 
 
229 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  43.72 
 
 
272 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  43.72 
 
 
272 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  44.81 
 
 
227 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  44.65 
 
 
232 aa  185  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  45.02 
 
 
233 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  46.85 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  42.73 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  47.62 
 
 
232 aa  181  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  44.71 
 
 
272 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  45.21 
 
 
228 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  43.26 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  44.65 
 
 
227 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  40.91 
 
 
226 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  41.86 
 
 
266 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  43.72 
 
 
234 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  41.77 
 
 
252 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 
253 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  41.74 
 
 
272 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  41.77 
 
 
252 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  41.77 
 
 
252 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  41.77 
 
 
252 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  41.77 
 
 
252 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  42.25 
 
 
234 aa  174  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 
272 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  41.86 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  41.36 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  42.79 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  43.4 
 
 
233 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  44.29 
 
 
226 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  39.24 
 
 
252 aa  168  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  43.44 
 
 
228 aa  168  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  39.24 
 
 
252 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  39.24 
 
 
252 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  37.28 
 
 
226 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  39.24 
 
 
252 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  39.24 
 
 
252 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  38.82 
 
 
252 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  39.24 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  39.24 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  39.24 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  42.53 
 
 
228 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 
229 aa  164  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  40.62 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  40.62 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  40.62 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  39.25 
 
 
225 aa  158  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 
232 aa  157  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  40.54 
 
 
227 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  38.81 
 
 
227 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 
250 aa  155  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 
229 aa  154  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 
227 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  39.53 
 
 
227 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  39.53 
 
 
227 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  38.31 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 
216 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  37.38 
 
 
223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  37.61 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  39.2 
 
 
250 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  34.42 
 
 
217 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  38.42 
 
 
214 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  36 
 
 
238 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  36 
 
 
238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  35.82 
 
 
226 aa  135  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  36.52 
 
 
242 aa  134  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  35.53 
 
 
240 aa  134  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  37.91 
 
 
256 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>