More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0440 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
235 aa  473  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  73.28 
 
 
241 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  72.84 
 
 
261 aa  327  9e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  70 
 
 
242 aa  313  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  70.32 
 
 
225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  67.12 
 
 
221 aa  284  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  63.16 
 
 
234 aa  278  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  64.32 
 
 
250 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  60.94 
 
 
262 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  51.6 
 
 
233 aa  214  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  52.75 
 
 
254 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  52.75 
 
 
254 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  52.75 
 
 
254 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  51.83 
 
 
256 aa  207  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  52.29 
 
 
251 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  54.63 
 
 
243 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  51.83 
 
 
251 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 
241 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  51.83 
 
 
254 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  53.7 
 
 
248 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  56.07 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  48.02 
 
 
242 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  48.02 
 
 
242 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  48.02 
 
 
242 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  48.02 
 
 
242 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  48.02 
 
 
245 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  48.02 
 
 
242 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  48.02 
 
 
245 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  48.25 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  47.56 
 
 
238 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  48 
 
 
240 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  48.62 
 
 
238 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  45.58 
 
 
227 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  49.56 
 
 
246 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  44.44 
 
 
226 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  41.2 
 
 
227 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  42.41 
 
 
226 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  45.58 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  42.15 
 
 
227 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  43.06 
 
 
224 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  37.1 
 
 
225 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  36.16 
 
 
225 aa  149  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  41.12 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  43.32 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  38.36 
 
 
228 aa  145  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  41.35 
 
 
227 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  40.45 
 
 
227 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  40.45 
 
 
227 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 
232 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  38.22 
 
 
228 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  40.74 
 
 
223 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  38.05 
 
 
235 aa  138  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 
225 aa  138  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  36.24 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  40.76 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  35.02 
 
 
230 aa  135  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 
224 aa  134  9e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  39.59 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  38.73 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 
225 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 
225 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  37.05 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  37.05 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  37.05 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  39.11 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 
235 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  41.06 
 
 
243 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  37.78 
 
 
229 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  38.54 
 
 
227 aa  131  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  37.9 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  39.59 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  38.64 
 
 
226 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  36.61 
 
 
252 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  36.61 
 
 
252 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  36.61 
 
 
252 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  36.61 
 
 
252 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  39.09 
 
 
227 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  36.61 
 
 
252 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  36.61 
 
 
252 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  37.12 
 
 
227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  32.59 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  36.16 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  38.58 
 
 
227 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 
272 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 
272 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  35.62 
 
 
272 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  36.07 
 
 
227 aa  125  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  35.56 
 
 
272 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  35.16 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 
232 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  38.35 
 
 
232 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  40.91 
 
 
237 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  34.88 
 
 
227 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>