More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0220 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  68.14 
 
 
235 aa  321  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  67.7 
 
 
235 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  66.82 
 
 
227 aa  316  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  69.12 
 
 
225 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  67.27 
 
 
226 aa  307  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  66.97 
 
 
225 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  66.97 
 
 
225 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  66.97 
 
 
225 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  65.93 
 
 
227 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  65.92 
 
 
227 aa  304  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  65.47 
 
 
227 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  65.02 
 
 
227 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  65.93 
 
 
232 aa  290  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  62.16 
 
 
229 aa  260  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  59.91 
 
 
228 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 
225 aa  217  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  47.66 
 
 
253 aa  198  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  48.2 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  46.15 
 
 
252 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  46.15 
 
 
252 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  46.88 
 
 
226 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  46.72 
 
 
233 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  45.73 
 
 
252 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  45.73 
 
 
252 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  47.03 
 
 
227 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  45.73 
 
 
252 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  46.98 
 
 
232 aa  192  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  45.73 
 
 
252 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  45.73 
 
 
252 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  45.73 
 
 
252 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  45.3 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  45.3 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  45.3 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  46.9 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  47.96 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  44.87 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  44.87 
 
 
252 aa  188  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  44.87 
 
 
252 aa  187  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  46.73 
 
 
226 aa  185  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  48.17 
 
 
226 aa  185  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  46.51 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  45.5 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  45.5 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  45.5 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  45.16 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  46.4 
 
 
227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  44.84 
 
 
232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  44.34 
 
 
234 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  42.73 
 
 
227 aa  179  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  45.5 
 
 
225 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  42.67 
 
 
226 aa  178  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 
272 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  44.65 
 
 
230 aa  176  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  44.34 
 
 
234 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  47.91 
 
 
232 aa  175  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 
272 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  44.75 
 
 
272 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  44.75 
 
 
272 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  44.08 
 
 
227 aa  174  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  44.75 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  41.1 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  45.83 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  41.1 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 
272 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  42.79 
 
 
227 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  42.79 
 
 
227 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  41.7 
 
 
272 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  39.55 
 
 
227 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  44.81 
 
 
216 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  43.6 
 
 
225 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  42.01 
 
 
226 aa  164  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  41.07 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  44.78 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  42.25 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 
228 aa  157  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  44.21 
 
 
227 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  46.15 
 
 
224 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  40.89 
 
 
254 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  40.89 
 
 
254 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  40.89 
 
 
254 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  40.89 
 
 
251 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  40.49 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  40.5 
 
 
254 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  39.3 
 
 
251 aa  151  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  40.55 
 
 
221 aa  151  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  42.25 
 
 
233 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  39.9 
 
 
238 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  41.12 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  39.11 
 
 
240 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  37.93 
 
 
242 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  37.96 
 
 
248 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  37.81 
 
 
245 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  37.81 
 
 
245 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  37.81 
 
 
242 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  37.81 
 
 
242 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  37.81 
 
 
242 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  37.81 
 
 
242 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  37.81 
 
 
242 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>