More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3850 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
252 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
252 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  99.6 
 
 
252 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  98.81 
 
 
252 aa  506  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  99.6 
 
 
252 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  90.87 
 
 
252 aa  470  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  90.87 
 
 
252 aa  470  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  90.87 
 
 
252 aa  470  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  90.87 
 
 
252 aa  471  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  90.48 
 
 
252 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  90.48 
 
 
252 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  90.48 
 
 
252 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  90.48 
 
 
252 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  89.68 
 
 
252 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  77.47 
 
 
253 aa  407  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  60.08 
 
 
232 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  60.08 
 
 
233 aa  291  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  61.6 
 
 
232 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  61.6 
 
 
232 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  61.6 
 
 
232 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  56.45 
 
 
234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  56.85 
 
 
234 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  58.23 
 
 
232 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  45.06 
 
 
224 aa  202  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  46.22 
 
 
227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  44.49 
 
 
235 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  45.73 
 
 
231 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  44.21 
 
 
225 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  43.22 
 
 
235 aa  190  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  47.41 
 
 
228 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  44.73 
 
 
228 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  44.86 
 
 
227 aa  188  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  46.32 
 
 
272 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  46.84 
 
 
272 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  45.89 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  45.99 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  46.84 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  45.65 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  45.92 
 
 
226 aa  181  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  40.76 
 
 
225 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  42.19 
 
 
227 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  42.67 
 
 
226 aa  178  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  42.19 
 
 
227 aa  178  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  41.95 
 
 
227 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  45.61 
 
 
266 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  44.3 
 
 
272 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  42.19 
 
 
227 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  41.77 
 
 
226 aa  175  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  46.09 
 
 
272 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  42.42 
 
 
225 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  42.42 
 
 
225 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  42.42 
 
 
225 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 
228 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  41.25 
 
 
232 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 
229 aa  168  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  44.54 
 
 
226 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  43.78 
 
 
223 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  43.23 
 
 
229 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  40.36 
 
 
225 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 
226 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  41.53 
 
 
229 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  40.34 
 
 
227 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  38.77 
 
 
227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  38.43 
 
 
227 aa  152  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 
226 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  36.77 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  40.69 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  37.72 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  38.63 
 
 
227 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  38.63 
 
 
227 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 
230 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  36.8 
 
 
225 aa  143  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
227 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  35 
 
 
238 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  33.19 
 
 
238 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  36.12 
 
 
240 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 
254 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  32.9 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  35.06 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  38.05 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  36.44 
 
 
241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  35.37 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  34.57 
 
 
262 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
223 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  34.07 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  35.43 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  33.61 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 
261 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 
241 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  35.19 
 
 
223 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>