More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4462 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 250 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  68.7 
 
 		 234 aa  318  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  63.33 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  63.16 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  62.61 
 
 		 225 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  62.72 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  61.73 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  63.84 
 
 		 235 aa  271  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  64 
 
 		 221 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  50.64 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  50.86 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  50.42 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  51.8 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  51.8 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  51.8 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  52.68 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  51.35 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  50.9 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 242 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  51.35 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  49.15 
 
 		 238 aa  201  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  49.36 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  47.58 
 
 		 242 aa  198  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  50.42 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  46.7 
 
 		 243 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  46.7 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  47.58 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  41.74 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  41.48 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  42.6 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  41.05 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  39.3 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  40.64 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  40.81 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  39.13 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  39.37 
 
 		 225 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  41.07 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  39.82 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  39.82 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  36.44 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  41.1 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  38.77 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  38.36 
 
 		 228 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  37.14 
 
 		 235 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  38.01 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  34.67 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  38.39 
 
 		 272 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  36.2 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  34.62 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  36.61 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  36.55 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  33.04 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  36.99 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  37.91 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  36.8 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  36.13 
 
 		 272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  36.73 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  37.75 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  35.62 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  35.62 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  36.53 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  39.73 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  35.19 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  37.71 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  36.53 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  35.19 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  35.19 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  38.86 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  35.91 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  35.37 
 
 		 252 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  35.19 
 
 		 252 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  35.37 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  35.37 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  35.37 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  35.37 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  37.07 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  36.2 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  36.2 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  37.25 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  35.37 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  35.37 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  35.37 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  35.37 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  38.39 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  38.73 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  35.62 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>