More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2757 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  96.3 
 
 		 248 aa  454  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  84.49 
 
 		 246 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  61.78 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  62.07 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  53.72 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  56.56 
 
 		 238 aa  234  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  55.08 
 
 		 251 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  55.51 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  55.08 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  55.51 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  55.51 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  55.51 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  56.11 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  55.35 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  55.61 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  55.66 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  55.66 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  55.66 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  55.66 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  55.66 
 
 		 245 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  55.66 
 
 		 242 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  55.66 
 
 		 245 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  52.02 
 
 		 242 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  54.67 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  48.88 
 
 		 225 aa  208  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  50.66 
 
 		 261 aa  204  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  50.66 
 
 		 241 aa  204  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  50.92 
 
 		 221 aa  198  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  45.74 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  46.7 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  45.91 
 
 		 227 aa  188  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  44.92 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  46.02 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  43.87 
 
 		 226 aa  178  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  44.44 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  43.06 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  43.58 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  43.6 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  39.34 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  39.19 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  39.19 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  38.08 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  42.27 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  39.34 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  37.92 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  39.11 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  38.86 
 
 		 272 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  40.77 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  40.65 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  41.06 
 
 		 272 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  39.34 
 
 		 272 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  38.86 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  38.92 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  35.89 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  34.55 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  37.16 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  34.93 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  37.27 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  34.25 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  34.93 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  41.78 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  36.82 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  34.66 
 
 		 252 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  34.26 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 		 227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  35.4 
 
 		 218 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  33.86 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  34.93 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  34.78 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>