More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3887 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
227 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  98.68 
 
 
227 aa  460  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  96.92 
 
 
227 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  95.59 
 
 
227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  90.99 
 
 
226 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  88.29 
 
 
225 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  88.29 
 
 
225 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  88.29 
 
 
225 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  87.84 
 
 
225 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  71.23 
 
 
235 aa  330  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  67.73 
 
 
235 aa  315  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  68.18 
 
 
227 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  69.41 
 
 
232 aa  307  9e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  65.92 
 
 
231 aa  304  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  67.87 
 
 
229 aa  287  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  66.51 
 
 
228 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  49.3 
 
 
227 aa  204  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  45.66 
 
 
225 aa  201  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  48.64 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  46.05 
 
 
233 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  49.77 
 
 
228 aa  195  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  44.95 
 
 
226 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  46.26 
 
 
232 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  46.7 
 
 
226 aa  191  9e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  47.25 
 
 
225 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  44.98 
 
 
227 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  45.79 
 
 
234 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  44.58 
 
 
253 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  45.25 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  45.25 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  45.25 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  47.75 
 
 
232 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  45.79 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  44.29 
 
 
224 aa  182  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  45.37 
 
 
223 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  44.19 
 
 
225 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  44.24 
 
 
226 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  43.64 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  42.19 
 
 
252 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 
266 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  42.19 
 
 
252 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  42.19 
 
 
252 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  42.19 
 
 
252 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  41.77 
 
 
252 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  43.04 
 
 
252 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  43.18 
 
 
227 aa  175  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  43.18 
 
 
227 aa  175  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  41.44 
 
 
227 aa  175  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  43.18 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  42.19 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  42.19 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  42.19 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  42.01 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 
272 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  43.78 
 
 
272 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  40.62 
 
 
225 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  43.19 
 
 
229 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  42.01 
 
 
226 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 
272 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  40.65 
 
 
272 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  43.69 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 
227 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
272 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  38.94 
 
 
238 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  43.6 
 
 
216 aa  157  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 
227 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  38.94 
 
 
238 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  43.16 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  42.52 
 
 
233 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  37 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  36.12 
 
 
254 aa  151  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  36.12 
 
 
254 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 
254 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 
251 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 
254 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  37.2 
 
 
240 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 
251 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  39.63 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  36.91 
 
 
242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 
242 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 
242 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 
242 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 
245 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 
245 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 
242 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 
242 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 
229 aa  144  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 
242 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  38.74 
 
 
233 aa  141  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  39.05 
 
 
228 aa  141  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>