More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0460 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
229 aa  455  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  55.35 
 
 
216 aa  224  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 
227 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 
227 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  45.67 
 
 
223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 
226 aa  154  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  43.33 
 
 
227 aa  151  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  37.96 
 
 
225 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  40.65 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  37.85 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  40.48 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
225 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  40.48 
 
 
227 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 
227 aa  144  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  40.48 
 
 
235 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  40.48 
 
 
227 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  41.55 
 
 
226 aa  142  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  39.82 
 
 
226 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  39.72 
 
 
233 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  40.48 
 
 
227 aa  141  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  38.07 
 
 
225 aa  141  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  39.05 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  39.05 
 
 
226 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
228 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 
228 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  41.97 
 
 
224 aa  134  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  38.18 
 
 
227 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
227 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  38.32 
 
 
229 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 
266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  39.25 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  39.17 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  36.11 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  40.72 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  39.71 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.5 
 
 
222 aa  128  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 
232 aa  128  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 
272 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 
250 aa  128  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  40.1 
 
 
229 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  38.1 
 
 
214 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  37.85 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  35.19 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 
272 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 
272 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  37.32 
 
 
234 aa  126  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  40.43 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  38.97 
 
 
461 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  39.05 
 
 
228 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  40.31 
 
 
227 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
233 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 
272 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.56 
 
 
222 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  35.98 
 
 
225 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  37.74 
 
 
272 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  36.92 
 
 
234 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 
217 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  37.74 
 
 
272 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  38.21 
 
 
246 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
230 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
231 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  34.8 
 
 
253 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2787  phosphoglycolate phosphatase  42.49 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485008  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  39.63 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  36.97 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  38.97 
 
 
256 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  41.58 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  41.58 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  39.05 
 
 
227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  35.58 
 
 
225 aa  118  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  38.57 
 
 
233 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  36 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  38.18 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  35.4 
 
 
252 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 
272 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  35.4 
 
 
252 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  36.21 
 
 
252 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  36.21 
 
 
252 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  35.4 
 
 
252 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  35.4 
 
 
252 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  35.4 
 
 
252 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  36.21 
 
 
252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  36.21 
 
 
252 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>