More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2701 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
230 aa  454  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  68.75 
 
 
233 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  68.75 
 
 
233 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  67.89 
 
 
233 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  67.43 
 
 
233 aa  275  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  67.89 
 
 
233 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  57.21 
 
 
232 aa  248  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  54.38 
 
 
227 aa  240  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  54.42 
 
 
234 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  57.66 
 
 
231 aa  234  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  53.98 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  54.98 
 
 
233 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  52.51 
 
 
225 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  52.61 
 
 
225 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  56.02 
 
 
225 aa  221  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  51.82 
 
 
227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  55.3 
 
 
228 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  54.03 
 
 
231 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  51.3 
 
 
225 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  52.13 
 
 
237 aa  207  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  52.78 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  48.85 
 
 
238 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  46.23 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  46.58 
 
 
238 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  47.71 
 
 
227 aa  185  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  48.71 
 
 
232 aa  175  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  45.71 
 
 
461 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  44.04 
 
 
224 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  43.04 
 
 
237 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  41.47 
 
 
250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  43.06 
 
 
229 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  42.58 
 
 
229 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 
227 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 
227 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  42.6 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 
227 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  39.3 
 
 
226 aa  138  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  43.81 
 
 
224 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 
221 aa  135  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  35.78 
 
 
226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 
227 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 
235 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  39.57 
 
 
216 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  37.27 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  42.47 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  37.16 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  39.59 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  37.9 
 
 
226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  38.83 
 
 
228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 
235 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  36.7 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  39.52 
 
 
218 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  39.52 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 
227 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 
256 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  38.18 
 
 
225 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 
227 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 
225 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 
225 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  37.26 
 
 
225 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
229 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  39.35 
 
 
257 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
214 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  40.29 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  36.4 
 
 
233 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  36.11 
 
 
266 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  36.56 
 
 
221 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  34.25 
 
 
225 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 
227 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 
227 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  34.84 
 
 
272 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 
227 aa  118  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  37.23 
 
 
218 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
224 aa  118  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  37.26 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  35 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  34.54 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  34.86 
 
 
228 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.38 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  38.39 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  41.58 
 
 
238 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 
231 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 
243 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  36.84 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  34.82 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  36.97 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  35.55 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  37.14 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  33.78 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  36.15 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  34.82 
 
 
272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>